Python Job: Mitarbeiter (m-w-d) für Linux-basierte anwendungso

„One Health“ – dafür steht das Bayerische Landesamt für Gesundheit und Lebensmittelsicherheit (LGL) als interdisziplinäre, wissenschaftliche Fachbehörde. Denn die Gesundheit umfasst viele Aspekte – so liefern nur gesunde Tiere gesunde Lebensmittel, und nur eine gesunde Umwelt ermöglicht körperliches, geistiges und soziales Wohlergehen.

Gemeinsam mit Kolleginnen und Kollegen aus der Lebensmittelchemie, der Human- und Veterinärmedizin sowie weiteren (natur-)wissenschaftlichen Disziplinen und der Verwaltung arbeiten wir für die Gesundheit von Mensch und Tier und damit für einen modernen Gesundheits- und Verbraucherschutz in Bayern. Unterstützen Sie uns hierbei an einem unserer zahlreichen Standorte!

Das Bayerische Landesamt für Gesundheit und Lebensmittelsicherheit (LGL) sucht für das Sachgebiet GI2 „Public Health Mikrobiologie“ in Oberschleißheim zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine/n

Mitarbeiter/in (m/w/d) für Linux-basierte anwendungsorientierte IT-Systemadministration und Bioinformatik
Kennziffer 2391

Die NGS-Coreunit bei welcher die Stelle verankert ist, beschäftigt sich mit der sequenzbasierten Analyse von Krankheitserregern und verknüpft die generierten Daten mit verschiedenen Datenbanken um molekulare Ausbruchsaufklärung sowie Feintypisierung im Zuge des Öffentlichen Gesundheitsdienstes sicherzustellen. Zur Datenanalyse werden verschiedene Programme und Pipelines genutzt, die teilweise Windows-, aber hauptsächlich Linux-basiert auf extern gehosteten Servern laufen.

• Strukturierte Pflege der IT-Infrastruktur im Bereich des Next Generation Sequencing (NGS)
• Entwicklung von IT-Systemen durch Bereitstellung neuer Funktionen: Installationen, Konfiguration von Netzwerkkomponenten, Archivierungsroutinen für NGS-Datensätze und Abbilden von Datenschutzrichtlinien
• IT-Support des NGS-Teams bei Softwarefragen, Problemen und Wartung
• Erweiterung der Serverkapazitäten und Serverinfrastruktur in Zusammenarbeit mit dem Rechenzentrum Süd
• Kommunikation und Zusammenarbeit mit anderen Fachabteilungen innerhalb der Behörde (Speichermedien, IT-Sicherheit, Laborinformationssystem)
• Austausch mit externen Partnerbehörden und Kontrolle von Datenströmen, Integrieren von Austauschplattformen
• Optimierung und Automatisierung von IT-Prozesse zur Abarbeitung von Sequenz-Auswertung

• Erfolgreich abgeschlossenes Hochschulstudium der Informatik oder einer ähnlichen Fachrichtung, z.B. Bioinformatik (Bachelor, Master, Diplom, ggf. mit Promotion)
• Alternativ eine erfolgreich abgeschlossene Aus- bzw Weiterbildung als IT-Systemadministrator/in (m/w/d) / Fachinformatiker/in (m/w/d) Systemintegration oder mehrjährige Berufserfahrung in der IT
• Fundierte Kenntnisse und einschlägige Erfahrung in der Systemadministration Unix-basierter Systeme sowie im Umgang mit eingeschränkten Root-Rechten
• Erfahrung mit Paketmanager-Tools (z.B. Conda) und der Integration von Multiuser-fähigen Anwendungen
• Erfahrung im Programmieren von Skripten und Softwarepipelines (möglichst Python, Bash)
• Interesse an infektions- und molekularepidemiologischen Fragestellungen
• Teamfähigkeit, Belastbarkeit, Organisationsfähigkeit
• Wünschenswert ist Erfahrung in molekularbiologischen Genotypisierungsmethoden und FOSS-Tools (z.B. Pangolin, iVar, SAMtools) sowie epidemiologischen Methoden
• Umfassende Deutschkenntnisse (mindestens Sprachniveau B2 des GER)

Die Einstellung erfolgt zunächst im Wege eines bis zum 30.09.2024 befristeten tarifrechtlichen Arbeitsverhältnisses. Die Vergütung richtet sich nach den Regelungen des TV-L. Die konkrete Zuteilung der Aufgaben bemisst sich an den Qualifikationen, Fähigkeiten und persönlichen Voraussetzungen der Bewerbenden, woraus die entsprechende Eingruppierung bis zur Entgeltgruppe E 13 einhergeht, gegebenenfalls zuzüglich Gewährung einer persönlichen Zulage.

Wenn wir Ihr Interesse geweckt haben, dann bewerben Sie sich gerne bis zum 05.06.2023 über unser Onlinebewerbungsportal auf https://lgl-bayern-karriereportal.mein-check-in.de/list. Weitere Informationen zum Bewerbungsverfahren, die Bestandteil dieser Ausschreibung sind, finden Sie ebenfalls auf unserer Website.

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Wir freuen uns auf Sie!

Für Fragen stehen Ihnen Herr Prof. Dr. Dr. Sing, Tel. 09131 6808-5814, und Herr Dr. Ackermann, Tel. 09131 6808-5172, gerne zur Verfügung.

Bayerisches Landesamt für
Gesundheit und Lebensmittelsicherheit
Z2 – Personalwesen
Eggenreuther Weg 43 | 91058 Erlangen
www.lgl.bayern.de